下计策，派遣将领占据锦州、松山、杏山、右屯及大、小凌河等地，并修缮城防长期驻守，宁远因此成为内地，开疆复土两百里。
同年十月，孙承宗遭到罢免，高第接替其职。高第认为关外一定会守不住，命令军队全部撤出锦州及右屯等地，督屯通判金启倧上书给袁崇焕说：“锦州、右屯、大凌三城都是前锋要地，如果撤兵，已经安居的百姓将再次被迁徙，收回的疆土再次沦陷，关内外经得住几次退守？”
袁崇焕也向高第极力争辩：“兵法上说，有进无退，收回的疆土怎么能轻易放弃？锦州、右屯动摇，宁远便会难保，进而使关门失去了保障。这些地方只需要派遣良将守卫，就不需要太多的顾虑。”
但高第执意要撤离，并且想要撤掉宁远的军队，但袁崇焕表示宁愿死在宁远，也不愿撤离，高第无法强迫袁崇焕，于是将锦州等地军民尽数撤离，丢弃米粟十余万，在迁徙路上死亡的人非常多，哭声震野，军民怨声载道，
……
说起这桩往事，袁崇焕沉痛无比地道：“《六国论》都说得清楚，六国破灭，非兵不利，战不善，弊在赂秦，以地资敌，助女真，与赂秦何异？”
颜常武静静地聆听，脸上亦是一副沉痛之色。
袁崇焕露出嘲讽的笑容道：“女真被人称为满万不可敌，本督守坚城，城城抵挡，看他们能有多少个满万，只要不满万，岂能够破我大明！”
“可是常武你可知道，女真人中有多少是汉人吗？！”
他愤怒地道：“敌酋进入辽西，大量汉民沦为奴隶，为他们耕种田地种粮食资军用，女真又从中编汉军户，每20汉人出一兵，上战场消耗都用汉军户，我们是汉人打汉人，结果女真人损失不大！”
“女真人攻城，多收买内应，里应外合，如果我们能够万众一心，女真也是人，本督让他们来得去不得！”气得袁崇焕一拍桌子道。
“再有，畏战，左右掣肘！”颜常武插嘴道。
“正是！”袁崇焕再拍一掌在台上道。
这边敌人一心想来抢人抢地，那边自己人的背后来捣蛋，这战难呐！
说起天启六年（1626年）正月，努尔哈赤得知孙承宗被罢免，于是率领大军西渡辽河，二十三日，后金军抵达宁远，经略高第和总兵杨麟拥重兵于山海关，不去救援宁远。
袁崇焕得知后，随即写下血书，与大将满桂，副将左辅、朱梅，参将祖大寿，守备何可纲等将士盟誓，以死守城。袁崇焕一面