皇太极引兵入关，袁崇焕听闻后率领祖大寿，何可刚入关守卫。
大军所经过的蓟州，抚宁，永平，迁安，丰润，玉田各城，袁崇焕都分兵留守。
朱由检得知此事后非常高兴，下令嘉奖袁崇焕的部下，并让袁崇焕统领指挥各地援军。
只不过这一次皇太极显然是有备而来，不久之后，遵化，三屯营都被后金军攻破，赵率教也在遵化战役中身中流矢阵亡，巡抚王元雅，总兵朱国彦自尽而死。
随后皇太极率军越过蓟州往西，直逼京城，袁崇焕见状急忙率兵护卫京师。
待袁崇焕率军抵达京师后，朱由检召见袁崇焕，赏赐御用酒菜及貂裘慰劳袁崇焕。
而袁崇焕则是以兵马长途奔波，疲惫不已，请求入城休整，但遭到拒绝。
于是袁崇焕驻军城外，与后金军鏖战，双方互有胜负。
在袁崇焕的顽强抵抗下，皇太极始终没有能够取得使命紧张，双方就这样僵持了起来。
后皇太极又发动了几次进攻，可皆是袁崇焕挡住。
下令戴承恩在广渠门列阵，祖大寿于南面列阵，王承胤在西北列阵，袁崇焕在西面列阵以备战。
中午时刻，清骑兵从东南面进攻，祖大寿率兵奋力接战，而王承胤却拔阵向南避战。
后金军力战祖大寿不下，于是撤退，明将刘应国，罗景荣等人率兵进行追击，杀伤后金军千余人，而明军死伤也很多。
此战骨骺，袁崇焕又派遣任守忠率领五百人用火炮轰打金营，后金军被迫后撤，京都之围遂解。
袁崇焕率军击退了皇太极，解了京师之围，可这本来应该是大功一件的。
可是，当后金军退了之后，袁崇焕被召入宫，非但没有嘉赏，反而是被治罪。
朝堂之上，一众东林党人，诬陷袁崇焕和皇太极暗中勾连，故意放皇太极入关，这才导致京师之围。
此次皇太极率军从龙井关，大安口入关，而此地是属于蓟辽总理刘策所管辖。
袁崇焕则是在得知皇太极率军入关，直逼京城，所以才千里迢迢赶来救援，自认为有功无罪。
但是朝中大臣却认为是袁崇焕放清兵入关，于是纷纷诽谤袁崇焕与皇太极有勾结。
对此，朱由检也心生怀疑，这也是朱由检的性格，疑心很重。
而退走的皇太极，在得知袁崇焕的遭遇后，也意识到除掉此人的机会来了，当即就施展了一出离间计。